O MuHNA possui um calendário anual de ações periódicas que associam divulgação científica, cultura e diversão.

A Semana Nacional de Ciências e Tecnologia do Araguaia (SNCT-Araguaia) acontece a partir do mês de outubro. Está atividade é um dos principais eventos de divulgação científica do Mato Grosso e conta com ações itinerantes, exposição científicas e feiras de CT&I, ciência móvel, portas abertas, seminário, manifestações culturais de cunho científico e mostra de vídeos que são realizadas presencialmente. 

Outra atividade periódica é as  Férias no MuHNA. O conjunto de atividades acontece nos meses de janeiro e julho oferecendo uma programação especial, educativa e gratuita no recesso escolar.